הלימודים בחוג למקרא הם רב תחומיים מיסודם, ומקיפים מגוון רחב של נושאים וסגנונות הוראה.
קורסי החובה בחוג מספקים תשתית להבנת המקרא, ועוסקים בנושאים שונים כמו: תהליכי החיבור וההתקדשות של התנ"ך, פרשנות חז"ל וימה"ב, הרקע ההיסטורי והארכיאולוגי לתקופת המקרא, דרכי הסיפור המקראי, כלים להבנת העברית המקראית ועוד.
קורסי הבחירה בחוג אפשרים להעמיק את הידע והרחיב את המיומנויות שלנו בקריאת והוראת התנ"ך. חלק מהקורסים מתמקדים בספר אחד ומאפשרים הבנה טובה יותר של דרכי הקריאה והפרשנות בסוגה מקראית מסוימת (סיפור, שירה, נבואה, חוק, חכמה); חלק מהקורסים עוסקים בסוגיות רוחביות והאופן בו הן באות לידי ביטוי בתנ"ך כגון אומנות הנאום, מנהיגות ומנהיגים, יחסי משפחה, מיתוסים ושברם, צדק חברתי; קורסים אחרים זולגים מן המקרא אל תולדות הפרשנות שלו החל ממגילות מדבר יהודה, דרך פרשנות יהודית, נוצרית, ומוסלמית, ועד לפרשנות באומנות ובמדיה.